1954 年9 月14 日，第二机械工业部（简称二机部）部长赵尔陆向国家计委呈报关于成立《国防工业出版社及其编制》的报告。1954 年10 月28 日，二机部党组又向中宣部呈报《关于成立国防工业出版社的请示》。1954 年11 月11 日，中宣部批复二机部党组同意成立国防工业出版社。至此，国防工业出版社宣告成立，隶属二机部，并将1954 年11 月11 日定为国防工业出版社成立的日子。
1958 年3 月，第一机械工业部（简称一机部）与二机部合并，随之国防工业出版社与机械工业出版社合并。1958年4月，国防工业出版社由北京三里河路二机部迁到北京东交民巷，与机械工业出版社合署办公，但两社仍以各自名义出书。
1959 年7 月，合并的两社由东交民巷迁至北京西郊百万庄北街7 号办公。
1960 年9 月，合并的一机部和二机部分开，成立了第三机械工业部（简称三机部）。同年9 月5 日，国防工业出版社与机械工业出版社分开，国防工业出版社直属三机部。
1980 年1 月，国防工业出版社划归国务院国防工办领导；1983 年，划归国防科工委领导。1998 年4 月，中国人民解放军总装备部成立，至此，国防工业出版社隶属中国人民解放军总装备部。
组织序列表
人员情况
截止到2014 年9 月，社厂共有人员439 人。
其中：
在岗人员258 人（社175 人）;离退休人员181 人（社61 人）。
现任出版社领导班子成员（自左至右）
许西安/ 副社长 邢海鹰/ 总编辑 宋家明/ 党委书记 杨崇新/ 社长 郝刚/ 副社长 杨永桢/ 政治部主任
